數控火焰切割機的進給速度已從80年代的16m/min到現在的24～40m/min，機床主軸轉速也從2500r/min上升到現在6000～40000r/min，數控火焰切割機結構也從敞開型向封閉型轉變。在這樣的高速度和結構的情況下，一旦由于編程和操作失誤，操作者來不及按急停按鈕，刀具已與工件相撞。為避免出現機床和人身事故，在編程和操作時可采取以下措施(以FANUC系統為例)。
    編程員在編程時設定的工件坐標系原點應在工件毛坯以外，至少應在工件表面上。
    在正常情況下，工件坐標系原點可以設在任何地方，只要此原點與機床坐標系原點有一定的關系即可。但在實際操作時，萬一出現指令值為零或接近零時，刀具就會直指零或接近零的位置。在數控火焰切割機加工時，刀具將奔向機床工作臺面或夾具基面：在數控火焰切割機加工時，將奔向卡盤基面。這樣，刀具將穿透工件直指基準面。此時，若為快速移動，則必發生事故。
    FANUC數控火焰切割機系統一般設定：當省略小數點時，為最小輸入單位，通常為µm。當疏漏了小數點時，則輸入的值將縮小成千分之一，此時，輸入的值就會接近于零。或者，由于其他原因，使刀具本應離開工件但實際并未離開工件而進入工件之內。出現這種情況時，工件坐標系零點應設在工件以外或在工作臺(或夾具)基面上，其結果將是不一樣的。
    編程員和操作者在書寫程序時，對小數點要倍加小心。
    FANUC數控火焰切割機系統在省略小數點時為最小設定單位，而大多數國產系統及歐美的一些系統，在省略小數點時，則為mm，即計算器輸入方式。若你習慣了計算器輸入方式，則在FANUC數控火焰切割機系統上就會出現問題。不少編程員和操作者，可能兩種系統都要使用，為防止因小數點而使尺寸變小的情況，應在計算器輸入方式的程序中，也加上小數點。這樣做，對某類系統是多余的，但養成習慣后，就不會因為小數點而出現問題。
    為了使小數點醒目，在編程時往往把孤立的小數點寫成“.0”的形式。當然，系統在執行時，數值的小數點以后的零被忽略。
    操作者在調整工件坐標系時，應把基準點設在所有刀具物理(幾何)長度以外，至少應在最長刀具的刀位點上。
    對于工件安裝圖上的工件坐標系，操作者在機床上是通過設置機床坐標系偏移來獲得的。亦即，操作者在機床上設定一個基準點，并找到這一基準點與編程員設定的工件坐標系零點之間的尺寸，并把這一尺寸設為工件坐標系偏移。
    在數控火焰切割機上，可把基準點設在刀架旋轉中心、基準刀具刀尖上或別的位置。如果不附加另外的運動，則編程員指令的零，即為刀架(機床)的基準點移動到偏程的零位置。此時，若基準點設在刀架旋轉中心，則刀架必與工件相撞。為保證不相撞，則機床上的基準點不但應設在刀架之外，還應設在所有刀具之外。這樣即使刀架上裝有刀具時，基準點也不會與工件相撞。
    在數控火焰切割機上，X、Y軸的基準點在主軸軸心線上。但是，Z軸的基準點，可以設在主軸端或在主軸端之外的某點上。若在主軸端，當指令為零時，主軸端將到達坐標系指定的零位置。此時，主軸端的端面鍵將與工件相撞：若主軸上再裝有刀具，則必與工件相撞。為保證不相撞，則Z軸上的基準點應設在所有刀具長度之外。即使不附加別的運動，基準點也不會撞工件。